| 医疗机构名称 | 行政区划 | 经营性质 | 机构类别 |
| 深圳市人民医院 | 罗湖区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 中国医学科学院阜外医院深圳医院 | 南山区 | 非营利性医疗机构 | 心血管病医院 |
| 深圳市第三人民医院 | 龙岗区 | 非营利性医疗机构 | 传染病医院 |
| 深圳平乐骨伤科医院 | 坪山区 | 非营利性医疗机构 | 骨伤医院 |
| 深圳市康宁医院 | 坪山区 | 非营利性医疗机构 | 精神病医院 |
| 深圳市眼科医院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 眼科医院 |
| 深圳市罗湖区人民医院 | 罗湖区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 中山大学附属第八医院（深圳福田） | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市中医院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 中医（综合）医院 |
| 深圳市第二人民医院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市妇幼保健院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 妇幼保健院 |
| 深圳市儿童医院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 儿童医院 |
| 北京大学深圳医院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 广州中医药大学深圳医院（福田） | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 中医（综合）医院 |
| 华中科技大学协和深圳医院 | 南山区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市宝安区中医院 | 宝安区 | 非营利性医疗机构 | 中医（综合）医院 |
| 深圳市宝安区妇幼保健院 | 宝安区 | 非营利性医疗机构 | 妇幼保健院 |
| 深圳市龙华区人民医院 | 龙华区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市中西医结合医院 | 宝安区 | 非营利性医疗机构 | 中西医结合医院 |
| 深圳市龙华区中心医院 | 龙华区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市宝安区人民医院 | 宝安区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 中国科学院大学深圳医院（光明） | 光明区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市龙岗中心医院 | 龙岗区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市龙岗区人民医院 | 龙岗区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 深圳市龙岗区妇幼保健院 | 龙岗区 | 非营利性医疗机构 | 妇幼保健院 |
| 深圳龙城医院 | 龙岗区 | 营利性医疗机构 | 康复医院 |
| 香港大学深圳医院 | 福田区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 北京中医药大学深圳医院（龙岗） | 龙岗区 | 非营利性医疗机构 | 中医（综合）医院 |
| 南方医科大学深圳医院 | 宝安区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
| 中国医学科学院肿瘤医院深圳医院 | 龙岗区 | 非营利性医疗机构 | 肿瘤医院 |
| 中山大学附属第七医院（深圳） | 光明区 | 非营利性医疗机构 | 综合医院 |
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